３１３系は老朽化した１０３系、１１３系、１６５系の置き換えを目的として登場した形式です。登場時から編成両数や用途に合わせて０番台、３００番台、１０００番台、１５００番台、３０００番台と細かな番台区分があり、１９９９年１２月にはセントラルライナー用の８０００番台も登場しました。

　ＪＲ東海の近郊型電車初のＶＶＶＦインバータ（ＩＧＢＴ）制御であり、またシングルアームパンタグラフを搭載するなど近代的な車輌となっています。

　０番台、３００番台はオール転換クロスシートで、東海道線の快速系列車を中心に運用されています。０番台が４両基本編成、３００番台が２両付属編成となっていて、３００番台は主に増結用となっていますが、単独で２連として走る運用も存在します。

　３１３系８０００番台は定員制の快速セントラルライナー用として、１９９２年の１２月に登場しました。３両編成で２Ｍ１Ｔなのですが、編成全体でのＭＴ比を１：１にするために中間車の片側の台車にはモーターが取り付けられておらず、０．５Ｍ車となっています。

　基本構造は０番台などと変わらず、座席配置は３扉転換クロスシート、車端部のみボックス式固定クロスシートとなっています。しかしながら、セントラルライナーとして運用されるときは真ん中の窓を閉め切って片側２扉で使用するため、真ん中の扉には窓周りと同じ塗装が施されています。